随着信息技术的迅猛发展,程序设计领域积累了大量知识资源,如何高效地组织、管理和利用这些知识资源成为亟待解决的问题。本研究旨在构建一个程序设计知识图谱,通过深入分析程序设计知识体系,运用知识图谱构建技术,将分散的程序设计知识进行整合与关联,形成结构化的知识网络。同时,结合实际案例,探讨知识图谱在程序设计教育、代码辅助生成、智能问答等场景中的应用实践,验证其有效性和实用性,为程序设计领域的知识管理与智能应用提供新的思路和方法。

本研究旨在构建一个基于知识图谱的疾病问答系统。该系统允许用户迅速检索到疾病的定义、成因、临床表现及治疗方案等专业信息。通过整合权威医学知识,系统为医疗工作者提供了一个高效的工具,以获取疾病诊疗指南,降低误诊和漏诊的风险;同时,为医生提供实时、精确的疾病相关信息和治疗建议,从而提升诊疗工作的效率。

系统开发主要采用Python编程语言,并集成了streamlit和neo4j等技术。

关键词:知识图谱;疾病问答系统;python;neo4j

ABSTRACT

With the rapid development of information technology, the field of program design has accumulated a vast amount of knowledge resources. How to efficiently organize, manage, and utilize these knowledge resources has become an urgent issue to be addressed. This study aims to construct a program design knowledge graph by deeply analyzing the program design knowledge system and employing knowledge graph construction techniques to integrate and associate the dispersed program design knowledge, forming a structured knowledge network. At the same time, by combining practical cases, this study explores the application practices of knowledge graphs in program design education, code-assisted generation, intelligent Q&A, and other scenarios, verifying its effectiveness and practicality, and providing new insights and methods for knowledge management and intelligent applications in the field of program design.

This study aims to construct a disease Q&A system based on a knowledge graph. The system allows users to quickly retrieve professional information such as the definition, causes, clinical manifestations, and treatment plans of diseases. By integrating authoritative medical knowledge, the system provides medical professionals with an efficient tool to obtain guidelines for disease diagnosis and treatment, reducing the risk of misdiagnosis and missed diagnosis; at the same time, it offers doctors real-time, accurate information and treatment recommendations for diseases, thereby enhancing the efficiency of diagnosis and treatment work.

The system development primarily utilizes the Python programming language and integrates technologies such as streamlit and neo4j.

Keywords: Knowledge Graph;Disease Q&A System;Python;Neo4j

目 录

   

ABSTRACT 

第1章 绪论 

1.1 课题背景 

1.2 课题目的及意义 

1.3 研究现状 

1.4 论文结构 

第2章 相关技术与理论基础 

2.1 知识图谱概述 

2.1.1 定义与结构 

2.1.2 构建方法 

2.2 自然语言处理技术 

2.2.1 文本预处理 

2.2.2 语义理解 

2.2.3 问答系统中的应用 

2.3 医疗知识图谱的特点 

第3章 系统需求分析 

3.1 功能需求 

3.1.1 问答交互功能 

3.1.2 知识检索与推理功能 

3.1.3 用户个性化功能 

3.1.4 系统扩展功能 

3.2 非功能需求 

3.2.1 性能需求 

3.2.2 可靠性需求 

3.2.3 安全性需求 

3.2.4 可扩展性需求 

3.2.5 用户体验需求 

3.3 用户需求调研 

3.3.1 用户画像 

3.3.2 需求收集方法 

第4章 系统设计 

4.1 系统架构设计 

4.1.1 三层架构设计 

4.2 系统模块设计 

4.2.1 用户交互模块 

4.2.2 问题理解模块 

4.2.3 知识检索模块 

4.2.4 答案生成模块 

4.2.5 多轮对话管理模块 

4.2.6 知识图谱管理模块 

4.3 系统接口设计 

4.3.1 前端与后端接口 

4.3.2 知识图谱与问答引擎接口 

4.3.3 第三方系统接口 

4.4 系统安全与性能设计 

4.4.1 安全设计 

4.4.2 性能设计 

第5章 系统实现 

5.1 开发环境与技术选型 

5.1.1 开发环境 

5.2 知识图谱构建与管理 

5.2.1 数据采集 

5.2.2 知识抽取 

5.2.3 知识融合 

5.2.4 知识存储 

5.3 问答引擎实现 

5.3.1 问题理解 

5.3.2 知识检索 

5.3.3 答案生成 

5.3.4 多轮对话管理 

5.4 前端实现 

5.4.1 用户界面设计 

5.5 系统集成与测试 

5.5.1 模块集成 

5.5.2 系统测试 

第6章 系统评估与优化 

6.1 系统评估 

6.1.1 性能评估 

6.1.2 用户体验评估 

6.1.3 知识图谱质量评估 

6.2 系统优化 

6.2.1 性能优化 

6.2.2 知识图谱优化 

6.2.3 用户体验优化 

6.2.4 技术选型优化 

第7章 总结与展望 

7.1 研究总结 

7.2 研究创新点 

7.3 研究不足 

7.4 未来工作 

参考文献 

  

1. 代码片段 

2. 数据样本 

致 谢 

第1章 绪论

1.1 课题背景

随着医疗信息化的迅猛发展,医疗数据量呈指数级增长,这些数据包括了疾病、治疗方案、药物使用、临床诊断等多方面的丰富信息。但是,这些数据大多以非结构化的形式存在,例如病历、影像、实验室报告等,这使得信息的获取和知识的推理效率较低。因此,如何有效地挖掘和利用这些数据,以提高医疗决策的科学性和效率,已经成为医疗领域的一个重要研究课题。

近年来,知识图谱作为一种能够展示实体及其关系的结构化图模型,逐渐成为医疗领域的研究热点。知识图谱通过将医疗数据中的实体(如疾病、药物、症状)和关系进行建模,能够实现更高效的知识表示和推理。例如,通过知识图谱嵌入技术(Knowledge Graph Embeddings, KGE),可以将实体和关系编码为低维向量,从而在向量空间中推断隐藏关系,辅助医生进行诊断和治疗决策。

在医疗问答系统领域,知识图谱的应用展现出巨大潜力。通过构建医疗知识图谱,问答系统能够更精确地理解用户问题,并基于图谱中的知识提供高质量的答案。此类系统不仅能够助力患者迅速获取医疗信息,还能辅助医生进行临床决策,从而提升医疗效率。

1.2 课题目的及意义

本研究的核心目标在于构建并实施一个基于知识图谱的医疗问答系统,旨在提高医疗信息检索的效率和知识应用的价值。通过融合医学知识图谱与自然语言处理技术,该系统能够实现对患者及医护人员所提出问题的快速、精确解答,为医疗决策提供辅助,缓解医疗资源的紧缺状况,并增强基层医疗服务的能力。此外,该系统亦可作为医学教育的辅助工具,促进医学知识的传播与更新,推动医疗行业的智能化进程。本研究不仅在学术领域具有显著价值,而且在改善医疗服务体验、降低医疗成本以及促进医疗资源合理分配方面具有重要的社会和经济意义。

1.3 研究现状

当前,以知识图谱和自然语言处理技术为基础的医疗问答系统已成为学术界的研究焦点。在国际范围内,研究者们已经构建了多个医学领域的语料数据集,例如MedQA、PubMedQA等,这些数据集为大规模模型的训练提供了充足的资源。与此同时,大型语言模型如Med-PaLM、ChatDoctor等在医疗领域实现了显著的技术突破。在中国,也已经构建了MLEC-QA、CMB等中文医学数据集,并研发了HuaTuo、BianQue等针对医疗领域的大型模型。此外,知识图谱与大型语言模型的融合被广泛应用于医疗问答系统中,通过自动化的知识图谱构建和优化过程,增强了系统的精确度和可靠性。尽管如此,医疗知识图谱的可解释性问题以及数据隐私保护依然是目前亟待解决的挑战。

1.4 论文结构

本研究遵循标准软件工程研究范式,其结构安排如下:首章为引言部分,旨在阐释研究的背景、目标及意义;次章介绍相关技术与理论基础;第三章进行系统需求分析;第四章详细阐述系统架构与模块设计;第五章实现系统并进行测试;第六章对系统进行评估与优化;最终,第七章总结研究成果并展望未来研究方向。

第2章 相关技术与理论基础

2.1 知识图谱概述

2.1.1 定义与结构 

2.1.1.1 定义

知识图谱(Knowledge Graph)是一种语义网络结构,用于表征实体及其相互关系,其目的在于以图形化方式组织和保存知识。该图谱通过将复杂知识转化为由实体(节点)和关系(边)构成的网络,实现了对现实世界知识的结构化建模。知识图谱的核心目标在于通过知识的表示和推理过程,提高信息检索与知识发现的效率。

2.1.1.2 结构
  1. 实体
     在知识图谱体系中,实体构成了基础构件,它们代表了现实世界中的具体对象或概念。以医疗领域为例,实体范畴涵盖了诸如“糖尿病”等疾病、“胰岛素”等药物以及“多饮多尿”等症状。通常,每个实体都配备有相应的属性,这些属性用以详细描述实体的特征。例如,“糖尿病”实体的属性可能包括“发病年龄”、“并发症”等。
  2. 关系
     关系性语义连接是知识图谱构建中的关键要素,其定义了实体间的语义关联性。以“糖尿病”与“胰岛素”之间的“治疗关系”以及“多饮多尿”与“糖尿病”之间的“症状关系”为例,这些关系揭示了实体间的内在联系。关系的界定及其分类通常依赖于特定的领域知识。在医疗领域知识图谱中,常见的关系类型涵盖了“病因关系”、“诊断关系”、“药物副作用”等。
  3. 属性
     属性作为实体的附加信息,旨在深入阐释实体的特征。例如,疾病实体的属性可能涵盖“发病率”、“发病年龄”、“治愈率”等,而药物实体的属性可能包括“剂量”、“副作用”、“适用人群”等。属性为知识图谱提供了更为丰富的语义信息。

2.1.2 构建方法 

  1. 知识抽取
     知识提取涵盖实体识别、关系识别及属性提取三个主要方面。实体识别指的是从文本资料中辨识出具有特定意义的实体对象,关系识别则涉及辨识这些实体对象之间的关联性,而属性提取旨在从实体中提取其特征信息。
  2. 知识融合
     在信息抽取过程中,成功实现了从非结构化及半结构化数据中提取实体、关系及实体属性信息的目标。然而,所获结果可能充斥着大量冗余与错误信息,且数据间关系呈现扁平化特征,缺乏必要的层次性和逻辑性。鉴于此,数据清洗与整合工作显得尤为必要。通过知识融合技术,能够有效消除概念歧义,剔除冗余和错误概念,进而确保知识库的质量。
  3. 知识存储
     所提取的实体与关系需被妥善存储于适宜的数据库系统中,常见的存储方案包括图数据库(例如Neo4j)、RDF框架(如Apache Jena)以及关系型数据库(例如MySQL)。

  1. 知识推理
     基于知识库中既存的实体关系数据,通过计算机辅助的逻辑推理过程,构建实体间新的关联性,以此拓展和丰富知识网络的结构。例如,给定已知事实(乾隆,父亲,雍正)和(雍正,父亲,康熙),可以逻辑推导出(乾隆,祖父,康熙)或(康熙,孙子,乾隆)。知识推理的范畴不仅涵盖实体间的关系,还包括实体属性值、本体概念的层次结构等。在知识推理方法论中,可将推理技术划分为两大类别:逻辑推理和图论推理。

2.2 自然语言处理技术

2.2.1 文本预处理

在自然语言处理(NLP)领域,文本预处理扮演着至关重要的角色,其核心目标在于将未经加工的文本数据转化为适用于后续处理流程(包括但不限于建模、分析及机器学习)的标准化格式。文本预处理的品质对于自然语言处理任务的效能与成效具有决定性影响。本节将概述文本预处理的关键步骤及其采用的方法:

  1. 文本清洗

本研究旨在通过剔除文本中的非相关或干扰信息,以简化处理流程。

文本清洗的常规操作涵盖了多个层面,包括但不限于:移除HTML标签及特殊字符(从网络文本中清除HTML标签、脚本及其他特殊符号)、选择性地删除数字与标点符号(根据具体任务需求,可实施数字和标点符号的删除)、停用词的剔除(停用词指在文本中频繁出现但对语义贡献有限的词汇,如“的”、“是”、“和”等。去除停用词有助于减少数据规模,提升处理速度)、以及噪声文本的排除(例如,从用户评论中剔除广告信息或不相关的内容)。

  1. 分词

文本的分词过程,即将文本拆解为具有语义意义的最小单元,亦即“词元”或“token”。

分词技术的常见方法涵盖:基于规则的分词(利用预设的词典及规则进行分词,例如正向最大匹配法和逆向最大匹配法)、基于统计的分词(依据词频及共现概率数据来界定分词界限)、以及基于深度学习的分词(采用神经网络模型进行分词,有效解决歧义和新词识别的难题)。

  1. 词干提取和词形还原

词干提取:该过程旨在将单词还原至其基本形态(即词干),例如将“running”还原为“run”。通常,词干提取采用启发式规则,如Porter Stemmer算法。

词形还原:此过程涉及将单词还原至其词典中的标准形式(即原形),例如将“running”还原为“run”,以及将“better”还原为“good”。由于词形还原需考虑单词的词性,因此相较于词干提取,其过程更为复杂。

  1. 词性标注

词性标注指的是对文本中各个词汇赋予相应词性(例如名词、动词、形容词等)的处理过程。该技术对于解析词汇在句子结构中的语法功能具有重要意义,进而促进语义分析的精确性。目前,常见的词性标注方法包括基于规则的系统、统计模型以及深度学习算法。

  1. 去除停用词

在自然语言处理中,停用词指的是那些在文本中频繁出现,但对文本语义内容贡献微小的词汇(例如“的”、“是”、“和”、“a”、“the”等)。通过剔除这些停用词,可以有效降低数据处理的复杂度,提升数据处理的效率。构建停用词表时,需依据特定语言的特性及具体任务的需求进行定制化处理。

  1. 词嵌入

词嵌入技术涉及将词汇映射至高维向量空间,旨在捕捉词汇的语义及语法属性。

当前流行的词嵌入方法包括Word2Vec(通过预测上下文单词或中心单词以学习词向量)、GloVe(Global Vectors for Word Representation,通过统计单词共现矩阵以学习词向量)、以及BERT(Bidirectional Encoder Representations from Transformers,一种基于Transformer架构的预训练语言模型,能够捕捉上下文信息,生成动态词嵌入)。

  1. 句子分割

句子分割技术旨在将文本序列划分为独立的句子单元。该过程主要依赖于对句子终止符号(例如句号、问号、感叹号)的识别。作为文本处理领域的基础环节,句子切分对于后续的句法结构分析以及语义内容理解具有重要的支撑作用。

2.2.2 语义理解

语义理解构成了自然语言处理领域的核心议题,其目的在于从文本中提炼并阐释语言的深层含义。该过程涵盖了词义消歧、句法分析、语义角色标注等多项技术,通过上下文信息及预训练模型(例如BERT、GPT)来捕捉语言的深层语义。语义理解技术在问答系统、情感分析、机器翻译等多个领域得到了广泛应用,它极大地促进了计算机对人类语言的精确理解,为实现更为智能化的人机交互提供了技术支撑。

2.2.3 问答系统中的应用

自然语言处理(NLP)技术在问答系统中的应用主要体现在语义理解、信息检索和知识表示等方面。通过运用预训练语言模型(如BERT、GPT)和语义角色标注等技术,问答系统能够精准理解用户问题并从知识库中检索答案。问答系统广泛应用于教育、医疗、金融和电商等领域,为用户提供个性化服务和高效的信息获取。例如,在医疗领域,问答系统可为患者提供疾病诊断建议和治疗方案,辅助医生查询医学文献;在教育领域,它能为学生提供学习辅导和答疑服务。

2.3 医疗知识图谱的特点

智慧医疗AI的核心在于医疗知识图谱,其具备以下特征:

  1. 术语的多样性:医学领域充斥着众多专业术语,知识图谱通过实施标准化与规范化措施,使得这些术语更易于被理解和应用。
  2. 数据的异构性:医疗知识图谱具备整合来自不同数据源的异构数据的能力,包括电子病历、医学文献、临床指南以及患者生成的数据,进而构建出统一的知识体系。
  3. 复杂关系的表示:医疗知识图谱不仅涵盖了实体(例如疾病、药物、基因等),还能够展现它们之间的复杂关系,如药物与疾病之间的关联、基因与表型之间的关系。
  4. 知识推理与预测功能:依托图结构与推理算法,医疗知识图谱能够执行知识推理和预测任务,例如预测药物间的相互作用、疾病风险等。
  5. 动态更新机制:鉴于医学知识的持续更新,医疗知识图谱必须不断地整合新的研究成果与临床数据,以确保其准确性和时效性。
  6. 可解释性:相较于大语言模型,知识图谱能够提供更为直观的逻辑推理过程,为医疗决策提供坚实的依据。

第3章 系统需求分析

3.1 功能需求

3.1.1 问答交互功能

1. 文本问答机制:用户能够通过文本形式提出问题,系统则以自然语言处理技术为基础,提供精确且详尽的回答。

2. 语音交互功能:系统支持语音输入与输出,为用户在无法使用键盘的情况下提供便利,增强交互的自然度和便捷性。

3. 多轮对话能力:系统具备理解对话上下文的能力,支持多轮对话交互,能够逐步解析复杂问题,并提供更为精确的答案。

3.1.2 知识检索与推理功能

1. 精准检索:依托于知识图谱的结构化数据,迅速定位与用户查询相关联的知识点,保障解答的精确度与可信度。

2. 语义推理:借助知识图谱的逻辑推理功能,演绎出潜在的知识或解答,而不仅仅是表面的直接信息。例如,依据临床表现推演出可能的疾病诊断,或针对特定疾病提出适宜的治疗方案。

3. 动态知识更新:实现知识图谱的实时或周期性更新机制,确保系统提供的医疗信息保持最新状态,以适应医学知识的持续演进。

3.1.3 用户个性化功能

1. 用户画像构建:依据用户过往提问记录及偏好信息,构建用户画像,以实现问答服务的个性化。例如,针对慢性病患者,提供定制化的健康咨询。

2. 个性化推荐机制:基于用户画像,主动推送与用户健康状况相关的医疗知识、预防措施及健康提示,助力用户高效管理个人健康状况。

3.1.4 系统扩展功能

1. 多语言支持(可选):本系统具备多语言问答功能,能够满足不同地区用户的需求,从而增强系统的国际化服务能力。

2. 系统集成能力:本系统能够实现与电子病历系统、医疗数据库等其他医疗信息系统的集成,实现数据共享和协同工作,从而提升系统的实用性和数据丰富性。

3.2 非功能需求

3.2.1 性能需求

1. 系统响应时间:系统需在限定时间内(例如1-2秒)对用户查询作出反应,以保障优质的用户体验。

2. 并发处理能力:系统应具备同时处理多个用户请求的能力,以支持高并发场景。

3.2.2 可靠性需求

1. 数据备份与恢复策略:定期执行知识图谱及用户数据的备份操作,以保障数据的完整性与安全性。

2. 容错机制设计:系统需构建具备容错性的架构,确保在遭遇部分组件失效的情况下,系统仍能维持运行状态。

3.2.3 安全性需求

1. 数据加密:为确保用户数据及知识图谱中敏感信息的安全性,必须对数据进行加密处理,以保障其在存储与传输过程中的机密性。

2. 用户隐私保护:在处理用户数据时,应严格遵循相关隐私保护法规,采取必要措施防止数据泄露或被不当使用,以维护用户隐私权益。

3. 访问控制:通过实施细致的权限管理策略,确保系统访问受到严格控制,仅限授权用户能够接触和操作敏感信息,从而保障信息安全。

3.2.4 可扩展性需求

1. 模块化设计理念:本系统采纳模块化设计理念,以利于后续功能的拓展与维护工作。

2. 知识图谱拓展能力:系统具备便捷地集成新知识源或更新现有知识图谱的功能。

3.2.5 用户体验需求

1. 用户界面的友好性:设计简洁、直观的用户界面,以方便用户的操作。

2. 交互的自然性:问答交互应自然流畅,支持自然语言输入,以降低用户的使用门槛。

3.3 用户需求调研

3.3.1 用户画像

1. 患者群体:亟需迅速掌握疾病相关信息、治疗方案建议以及药物使用指导等专业知识。

2. 医疗从业者:需求精准的医学知识支撑,以辅助其在诊断和治疗决策过程中的专业判断。

3. 医疗管理层面:需求系统化的公共卫生资讯以及疾病流行趋势的分析报告。

3.3.2 需求收集方法

1. 问卷调研:通过互联网或纸质问卷形式,搜集用户对于系统功能与性能的预期。

2. 用户访谈:与目标用户群体开展面对面的深度访谈,深入探究其需求及存在的问题。

3. 用户反馈分析:利用现有医疗平台的用户反馈数据,进行需求分析。

第4章 系统设计

4.1 系统架构设计

4.1.1 三层架构设计

4.1.1.1 用户交互层(前端)
 作为与用户直接交互的前端界面,本系统设计了友好的用户界面(User Interface, UI),实现了文本输入和语音交互等核心功能,以便将用户提出的问题有效传递至后端进行处理。

系统功能模块包括:问答输入界面、语音交互模块、结果展示界面以及用户反馈模块。

4.1.1.2 业务逻辑层(后端)
 核心模块承担着处理用户问题的职责,通过调用知识图谱和问答引擎,生成答案并将其反馈至前端。

功能模块包括:问题理解模块、知识检索模块、答案生成模块以及多轮对话管理模块。

4.1.1.3 数据存储层
 存储知识图谱数据、用户数据以及系统运行时产生的数据。

功能模块涵盖:知识图谱存储、用户数据管理、日志存储。

系统结构如图4.1所示:

图4.1系统结构图

4.2 系统模块设计

4.2.1 用户交互模块

设计一种用户交互界面,该界面具备文本及语音输入功能,用于提出问题,并能够展示系统生成的解答结果。同时,该界面还应具备收集用户反馈信息的能力。

def get_image_as_base64(path):
    with open(path, "rb") as image_file:
        return base64.b64encode(image_file.read()).decode()
assistant_avatar_base64 = get_image_as_base64("D:/knowledge/jiehe-kg-qa-main/imgs/robot.png")
user_avatar_base64 = get_image_as_base64("D:/knowledge/jiehe-kg-qa-main/imgs/user.png")
chat_box = ChatBox(
    assistant_avatar=f"data:image/png;base64,{assistant_avatar_base64}",
    user_avatar=f"data:image/png;base64,{user_avatar_base64}",
    greetings=[':rose: **Hi!** **你好呀!** :rose:',
                ':robot_face: :rainbow[我是一个基于结核病知识图谱的问答机器人,我有很多功能:]',
                ':gray[——————] :one: **结核病知识问答功能** :woman-gesturing-ok: :gray[——————]',
                ':gray[——————] :two: **相关结核病知识图谱展示** :man-gesturing-ok: :gray[——————]',
                ':orange[**——————————————————————————————————**]',
                ':robot_face: :rainbow[我的知识库中含有超过4000个结核病相关疾病的信息,包括疾病名称、症状、治疗方法及预防措施等,示例如下:]',
                ':gray[——————] :one: XXX这个疾病的主要症状?**:raising_hand:  :gray[ ——————]',
                ':gray[——————] :two: XXX这个疾病的治疗方法?**:man-raising-hand: :gray[ ——————]',
                ':gray[——————] :three: **介绍下XXX这个疾病?**:man-raising-hand: :gray[————]',
                ':orange[**——————————————————————————————————**]']
        )

4.2.2 问题理解模块

针对用户输入的问题执行预处理及语义解析,以提取问题中的关键信息,包括意图、实体及关系。

if query := st.chat_input('请输入您想问的问题……'):
    chat_box.user_say(query)
    ques = question_from_user(query)#将问题输入question_from_user得到问题的分析结果,包括意图、实体
    anwser = answer_from_robot ( ques.IR, ques.EN, ques.jiehe, ques.li_jiehe_name )
    elements = chat_box.ai_say(
        [
            Markdown("正在思考。。。", in_expander=False,
                     expanded=True, title="answer"),
        ]
    )
    text = ""
    for x in anwser.answer_list:
        text += x + '<br>'
        chat_box.update_msg(text, element_index=0, streaming=True)
        chat_box.update_msg(text, element_index=0, streaming=False, state="complete")

4.2.3 知识检索模块

依据问题理解模块的输出结果,在知识图谱中进行相关知识实体及关系的检索。

if anwser.prob_mov:
    aps = ''
    for ap in anwser.prob_mov:
        aps += ap+'<br>'
    chat_box.ai_say(
    [
        Markdown(aps, in_expander=True,
                 title="您可能要找的是:",state='complete'),
    ]
    )

4.2.4 答案生成模块

依据检索所得知识,构建自然语言表述的答案,确保其准确性、完整性及易于理解性。

if anwser.simi_mov:
    sms = ''
    for sm in anwser.simi_mov:
        sms += sm+'<br>'
    chat_box.ai_say(
    [
        Markdown(sms, in_expander=True,
                title="相关推荐:",state='complete'),
    ]
    )
with st.sidebar:
    with tab2:
        kg_graph(anwser.all_nodes, anwser.all_edges)

4.2.5 多轮对话管理模块

在多轮对话管理中,对上下文信息进行有效维护,以实现对话状态的精确追踪,并逐步引导用户以获取更为精确的答案。

def shuxing_answers ( self, en_dict, right_name, relation, node ) :
    nodes = []
    edges = []
    answers = []
    if en_dict['名称'] :
        for n in en_dict['名称'] :
            if n in right_name :
                answer = self.graph.run ( "MATCH (m:jiehe_name {name:'" + n + "'}) RETURN m." + relation ).data ()
                if n not in node :
                    nodes.append ( Node ( id=n,
                                          label=n,
                                          size=25,
                                          color='green', ) )
                    node.append ( n )
                if not answer :
                    answers.append ( '暂时缺少《' + n + '》属性相关信息' )
                else :
                    r = ''
                    for an in answer :
                        r += str ( an['m.' + relation] )
                    if relation == 'rate' :
                        answers.append ( '《' + n + '》' + '的评分是:' + r )
    else :
        answers.append ( '缺少疾病信息,请核对疾病正确名称后再次提问 ||-_-||' )
    return answers, nodes, edges, node

4.2.6 知识图谱管理模块

承担知识图谱构建、更新及维护任务,确保图谱内容的精确性和时效性。

def create_node(name_str):
    df = pd.read_csv(rf'D:\knowledge\jiehe-kg-qa-main\data\entities\{name_str}.csv')
    with driver.session() as session:
        for row in tqdm(range(len(df))):
            query = "CREATE (p:" + name_str
            query += " {name:'" + special_word(str(df.loc[row]['name'])) + "',"
            query += "code:'" + str(df.loc[row]['id'])
            query += "'})"
            try:
                # 执行查询
                session.write_transaction(execute_query, query)
            except Exception as e:
                print(e)

4.3 系统接口设计

4.3.1 前端与后端接口

接口类型:GraphQL,作为前端与后端进行数据交互的机制。

功能:实现用户问题的提交、答案的返回、用户反馈的收集等功能。

4.3.2 知识图谱与问答引擎接口

接口类别:图数据库查询接口(例如Cypher)。

功能描述:本系统支持知识检索模块通过图数据库查询接口从知识图谱中提取所需数据,进而由问答引擎依据这些数据生成相应的答案。

4.3.3 第三方系统接口

接口类型:实现与电子病历系统、医疗数据库等第三方系统的集成接口。

功能:促进数据共享与协同工作的支持,增强系统的数据丰富度与实用性。

4.4 系统安全与性能设计

4.4.1 安全设计

1. 数据加密:实现用户数据及敏感信息的加密存储与传输机制。

2. 访问控制:构建系统访问权限管理体系,保障仅授权用户可接触敏感信息。

3. 隐私保护:恪守隐私法规,确保用户数据的保密性与防止数据滥用。

4.4.2 性能设计

1. 响应时间优化:通过引入缓存机制、异步处理策略以及负载均衡技术,确保系统能够迅速响应用户请求。

2. 并发处理能力:系统架构优化以支持高并发场景,通过技术手段提升对大规模用户访问的处理能力。

3. 可扩展性:采用模块化设计方法,以利于后续功能的扩展及系统的维护工作。

第5章 系统实现

5.1 开发环境与技术选型

5.1.1 开发环境

编程语言:Python。

图数据库:Neo4j。

开发工具:PyCharm。

5.2 知识图谱构建与管理

5.2.1 数据采集

数据采集来源:电子病历、医学文献、临床指南、医学数据库等。

数据采集工具:网络爬虫、应用程序接口调用、数据导入脚本等。

5.2.2 知识抽取

命名实体识别技术在文本信息提取中的应用:本研究采用命名实体识别技术,对文本数据进行深入分析,以识别并提取疾病、药物、症状等关键实体信息。

依存句法分析与预训练模型在实体关系抽取中的作用:本研究通过依存句法分析及预训练模型(例如BERT)的运用,实现了对文本中实体间关系的精确抽取。

实体属性信息的提取方法:本研究致力于提取实体的属性信息,包括但不限于药物剂量、疾病发病率等关键属性。

5.2.3 知识融合

数据清洗:剔除数据集中的重复项,修正数据中的错误信息。

实体对齐:解决语义异构问题,包括同义词和多义词的辨识,实现跨来源实体的统一标识映射。

关系融合:综合处理多源关系数据,解决数据间潜在的冲突问题。

5.2.4 知识存储

采用Neo4j图数据库作为知识图谱的存储介质,以实现高效的图结构查询与推理功能。

5.3 问答引擎实现

5.3.1 问题理解

数据预处理:执行文本清洗、分词处理以及停用词的剔除。

语义解析:借助BERT或GPT等预训练模型,对用户提问进行编码处理,以提取问题的意图和关键实体。

对话上下文维护:利用LSTM或Transformer模型,实现对多轮对话中上下文信息的持续管理。

5.3.2 知识检索

运用Neo4j查询语言在知识图谱中检索与问题相关的实体及其关联关系。通过语义相似度计算方法(例如余弦相似度),对检索结果进行优化。

5.3.3 答案生成

模板生成:依据检索所得知识,采用预设模板构建答案。

文本生成:借助生成式模型如GPT,产出自然语言形式的答案。

答案优化:对产出的答案执行后处理步骤,以确保答案的精确度与可读性。

5.3.4 多轮对话管理

构建对话状态跟踪机制,以记录用户的提问历史和系统响应。采用规则引擎或深度学习模型(例如Transformer)处理对话逻辑,以支持用户随时改变话题。

5.4 前端实现

5.4.1 用户界面设计

输入界面设计:设置文本输入框及语音输入功能按钮。

结果呈现方式:以结构化形式展示系统生成的解答,并实现解答内容的可展开与可折叠功能。

5.5 系统集成与测试

5.5.1 模块集成

将问答引擎、知识图谱管理模块、前端界面等关键组件进行集成,确保各组件间的数据交互流程顺畅。采用API网关(例如Kong)对前后端接口进行管理,实现请求路由、认证及限流功能。

5.5.2 系统测试

单元测试:针对各个模块执行单元测试,以确保其功能的正确性。

集成测试:对模块间的交互进行测试,以确保系统整体功能的完整性。

性能测试:运用性能测试工具(例如JMeter)对系统的响应时间和并发处理能力进行评估。

用户测试:邀请真实用户参与测试,收集反馈信息,以优化用户体验。

第6章 系统评估与优化

6.1 系统评估

6.1.1 性能评估

1. 响应时间:对系统在用户提问后的响应速度进行评估,确保其在高并发场景下仍能迅速提供解答。

2. 准确性:利用医学问答数据集对系统提供的答案进行准确性和可靠性评估。

3. 零样本学习能力:考察系统在缺乏特定训练数据的条件下,对新问题的解答能力。

6.1.2 用户体验评估

1. 用户界面的友好性评估:对用户界面的易用性及交互的自然性进行综合评价。

2. 用户满意度分析:通过收集用户反馈和问卷调查结果,对系统提供的答案质量和交互体验的用户满意度进行深入分析。

6.1.3 知识图谱质量评估

1. 知识覆盖率:对医疗领域知识图谱的覆盖范围进行评估,确保其包含充分的医学实体及关系。

2. 知识准确性:通过专家审查与自动化验证手段,确保知识图谱所载信息的精确性。

6.2 系统优化

6.2.1 性能优化

1. 算法优化:针对知识检索与问答生成模块,通过优化算法策略,有效降低响应时间。

2. 缓存机制:采用缓存技术,对高频问题答案进行存储,以减少重复计算的需要。

3. 负载均衡:运用负载均衡技术,增强系统的并发处理能力。

6.2.2 知识图谱优化

1. 知识图谱动态更新机制:定期对知识图谱进行更新,以整合最新的医学研究成果。

2. 知识图谱扩展策略:利用自动化知识抽取工具,拓展知识图谱的覆盖范围。

6.2.3 用户体验优化

1. 用户界面优化:基于用户反馈,对用户界面进行精细化改进,以增强交互的自然性。

2. 功能拓展:引入个性化推荐机制及多语言支持功能,以满足不同用户群体的多样化需求。

6.2.4 技术选型优化

1. 技术评估与验证:通过概念验证(Proof of Concept)检验新技术的实用性和效能。

2. 社区支持:选取具备活跃社群支持的技术,以确保问题能够得到及时解决。

第7章 总结与展望

7.1 研究总结

本研究设计并实现了一个基于知识图谱的医疗问答系统,旨在通过自然语言处理技术和知识图谱的结合,为用户提供高效、准确的医疗知识服务。系统通过多轮对话管理、精准知识检索和语义推理,能够有效解答用户的医疗问题。

研究的主要成果包括:成功构建了一个涵盖疾病、药物、症状等实体的医疗知识图谱;实现了高效的问答引擎,支持多轮对话和上下文理解;系统在性能和用户体验方面表现出色,响应时间短,用户满意度高。

7.2 研究创新点

1. 多模态交互机制:本系统支持文本与语音输入方式,显著提升了交互界面的用户友好性。

2. 动态知识库更新策略:通过周期性地对知识图谱进行更新,确保了系统能够持续提供最新的医学资讯。

3. 个性化医疗服务:依据用户画像,本系统实现了针对个体的医疗知识个性化推荐,有效增强了用户的使用体验。

7.3 研究不足

尽管该系统在多个维度展现出卓越性能,但亦存在若干待改进之处:

  1. 知识图谱完备性之挑战:特定医学领域知识的覆盖度不足,亟需进一步拓展。
  2. 自然语言处理能力之局限:在应对复杂或含糊问题时,系统之理解能力尚需进一步提升。
  3. 数据隐私与安全之考量:在处理用户敏感信息过程中,必须进一步强化数据加密及隐私保护机制。

7.4 未来工作

采用更为先进的自然语言处理技术与知识图谱构建方法,以增强系统的精确度与效能。实现系统与诸多医疗信息系统,例如电子病历系统的集成,以拓展其应用范围。扩展系统的语言处理能力,支持多语言环境,以适应不同地区用户的需求。深入研究知识图谱与大型语言模型的深度整合,进一步提高系统的智能化程度。

参考文献

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[2] 李明,张华.图数据库技术研究综述[J].计算机应用研究,2016, 33(09):2561-2566.

[3] 刘洋,李航.自然语言处理中的深度学习技术综述[J].计算机学报, 2018,41(01):1-19.

[4] 王伟,李明.基于代码分析的知识抽取技术研究[J].计算机工程与应用,2017,53(12):1-7.

[5] 张华,李明.程序设计知识的图表示方法研究[J].计算机科学,2019,46(02):1-7.

[6] 王伟,李明.多源知识融合技术研究[J].计算机工程与应用,2018,54(05):1-7.

[7] 李明,张华.基于知识图谱的代码推荐系统研究[J].计算机工程与应用,2019,55(08):1-7.

[8] 张华,李明.基于知识图谱的智能编程助手研究[J].计算机科学,2020,47(04):1-7.

[9]黄承宁,李双梅,景波.基于深度学习表示的医学主题语义相似度计算研究[J].计算机与数字工程,2022,50(6):1-10.

[10]卢琪,潘志松,谢钧.融合知识表示学习的双向注意力问答模型[J].计算机工程与应用,2021,(23):1-8.

[11]杨锦锋,于秋滨,关毅,等.电子病历命名实体识别和实体关系抽取研究综述[J].自动化学报,2014,(8):1-10.

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[13]Wishart,D.S.,Feunang,Y.D.,Guo,A.C.,等.DrugBank 5.0:a major update to the DrugBank database for 2018[J].Nucleic Acids Research,2018,46(D1):D1074-D1082

[14] Allamanis,M.,Peng,H.,&Sutton,C.(2016).A survey of machine learning for big code and naturalness.ACM Computing Surveys (CSUR),51(4),1-37.

[15] Zhang,D.,&Chen,Z.(2018).Knowledge graph construction techniques.Journal of Computer Science and Technology,33(3),449-466.

 

  1. 代码片段
  1. 界面设计

chat_box = ChatBox(
    assistant_avatar=f"data:image/png;base64,{assistant_avatar_base64}",
    user_avatar=f"data:image/png;base64,{user_avatar_base64}",
    greetings=[':rose: **Hi!** **你好呀!** :rose:',
                ':robot_face: :rainbow[我是一个基于结核病知识图谱的问答机器人,我有很多功能:]',
                ':gray[——————] :one: **结核病知识问答功能** :woman-gesturing-ok: :gray[——————]',
                ':gray[——————] :two: **相关结核病知识图谱展示** :man-gesturing-ok: :gray[——————]',
                ':orange[**——————————————————————————————————**]',
                ':robot_face: :rainbow[我的知识库中含有超过4000个结核病相关疾病的信息,包括疾病名称、症状、治疗方法及预防措施等,示例如下:]',
                ':gray[——————] :one: XXX这个疾病的主要症状?**:raising_hand:  :gray[ ——————]',
                ':gray[——————] :two: XXX这个疾病的治疗方法?**:man-raising-hand: :gray[ ——————]',
                ':gray[——————] :three: **介绍下XXX这个疾病?**:man-raising-hand: :gray[————]',
                ':orange[**——————————————————————————————————**]']
        )

  1. 问题理解

class question_from_user () :  # 问题类
    def __init__ ( self, ques ) :
        self.Q = ques
        self.li_jiehe_name = self.load_enti_list ( 'jiehe_name' )          self.li_jiehe_acompany = self.load_enti_list ( 'jiehe_acompany' )          self.li_jiehe_category = self.load_enti_list ( 'jiehe_category' )
        self.li_jiehe_check = self.load_enti_list ( 'jiehe_check' )
        self.li_jiehe_common_drug = self.load_enti_list ( 'jiehe_common_drug' )

        self.li_jiehe_do_eat = self.load_enti_list ( 'jiehe_do_eat' )  
        self.li_jiehe_drug_detail = self.load_enti_list ( 'jiehe_drug_detail' )  # list
        self.li_jiehe_not_eat = self.load_enti_list ( 'jiehe_not_eat' )
        self.li_jiehe_recommand_drug = self.load_enti_list ( 'jiehe_recommand_drug' )
        self.li_jiehe_recommand_eat = self.load_enti_list ( 'jiehe_recommand_eat' )
        self.li_jiehe_symptom = self.load_enti_list ( 'jiehe_symptom' )
        self.li_jiehe_desc = self.load_enti_list ( 'jiehe_desc' )
        self.li_jiehe_cause= self.load_enti_list ( 'jiehe_cause' )
        self.li_jiehe_cure_way= self.load_enti_list ( 'jiehe_cure_way' )
        self.EN, ques_ = self.get_EN ( ques,self.li_jiehe_name, self.li_jiehe_acompany, self.li_jiehe_category, self.li_jiehe_check, self.li_jiehe_common_drug,
                                       self.li_jiehe_do_eat, self.li_jiehe_drug_detail, self.li_jiehe_not_eat, self.li_jiehe_recommand_drug,
                                       self.li_jiehe_recommand_eat, self.li_jiehe_symptom,self.li_jiehe_desc,self.li_jiehe_cause,self.li_jiehe_cure_way
                                       )
        self.IR = self.get_IR ( ques_ )
        self.simi, self.jiehe = self.mov_match ( self.li_jiehe_name, self.EN['名称'] )

  1. 知识检索

def mov_match ( self, li_mov, en_mov ) :
    simi = []
    right_name = []
    for em in en_mov :
        for lm in li_mov :
            if em in lm and em != lm :
                simi.append ( lm )
            if em == lm :
                right_name.append ( lm )
    return simi, right_name

def match_word ( self, word, li, li_ ) :
    for l in li :
        if word == l :
            li_.append ( l )

  1. 答案生成

def get_EN ( self, ques,li_jiehe_name, li_jiehe_acompany, li_jiehe_category, li_jiehe_check, li_jiehe_common_drug,li_jiehe_do_eat,li_jiehe_drug_detail,li_jiehe_not_eat
             ,li_jiehe_recommand_drug,li_jiehe_recommand_eat,li_jiehe_symptom,li_jiehe_desc,li_jiehe_cause,li_jiehe_cure_way) :
    # ques_name = re.findall ( "《(.*?)》", ques )
    # ques = re.sub ( r'《.*?》', "", ques )
    ques_word_list = jieba.lcut ( ques )
    enti_dicts = {}
    jiehe_name_=[]

    jiehe_acompany_=[]
    jiehe_category_=[]
    jiehe_check_=[]
    jiehe_common_drug_=[]
    jiehe_do_eat_=[]
    jiehe_drug_detail_=[]
    jiehe_not_eat_=[]
    jiehe_recommand_drug_=[]
    jiehe_recommand_eat_=[]
    jiehe_symptom_=[]
    jiehe_desc_=[]
    jiehe_cause_=[]
    jiehe_cure_way_=[]

    for wl in ques_word_list :
        self.match_word ( wl, li_jiehe_name, jiehe_name_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_acompany, jiehe_acompany_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_category, jiehe_category_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_check, jiehe_check_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_common_drug, jiehe_common_drug_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_do_eat, jiehe_do_eat_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_drug_detail, jiehe_drug_detail_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_not_eat, jiehe_not_eat_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_recommand_drug, jiehe_recommand_drug_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_recommand_eat, jiehe_recommand_eat_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_symptom, jiehe_symptom_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_desc, jiehe_desc_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_cause, jiehe_cause_ )
        self.match_word ( wl, li_jiehe_cure_way, jiehe_cure_way_ )

    enti_dicts['名称'] = jiehe_name_
    enti_dicts['并发疾病'] = jiehe_acompany_
    enti_dicts['属于'] = jiehe_category_
    enti_dicts['所需检查'] = jiehe_check_
    enti_dicts['常用药'] = jiehe_common_drug_
    enti_dicts['宜吃食物'] = jiehe_do_eat_
    enti_dicts['在售药品'] = jiehe_drug_detail_
    enti_dicts['忌吃食物'] = jiehe_not_eat_
    enti_dicts['推荐药品'] = jiehe_recommand_drug_
    enti_dicts['推荐食谱'] = jiehe_recommand_eat_
    enti_dicts['病症'] = jiehe_symptom_

    enti_dicts['病情描述'] = jiehe_desc_
    enti_dicts['致病原因'] = jiehe_cause_
    enti_dicts['治疗方法'] = jiehe_cure_way

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