关于R安装plink2R报错问题
这是plink2R-master.zip中的文件内容,DESCRIPTION文件实际是在plink2R文件夹中,所以这个plink2R才是真正的安装包,将这个目录压缩然后再去R中本地安装。然后就是本地安装环节,但是本地安装报错了,没有DESCRIPTION这个文件,因为每个人写的R包中,文件夹都会有一个这个文件(还好之前写过一个,知道这个文件)。本地安装时,参数也一定要给对,因为这里边的type默
最近要用R语言读取bfile格式的基因型文件,所以需要在R中安装这个包
安装开始就是尝试使用install.package("plink2R")和BiocManager::install("plink2R")
两种都没有安装成功,那没办法了,索性去下载源码安装
地址https://github.com/gabraham/plink2R#

下载之后会得到一个压缩包:plink2R-master.zip
然后就是本地安装环节,但是本地安装报错了,没有DESCRIPTION这个文件,因为每个人写的R包中,文件夹都会有一个这个文件(还好之前写过一个,知道这个文件)。

这是plink2R-master.zip中的文件内容,DESCRIPTION文件实际是在plink2R文件夹中,所以这个plink2R才是真正的安装包,将这个目录压缩然后再去R中本地安装。

本地安装时,参数也一定要给对,因为这里边的type默认是both,我们设置了repos=NULL,还需要加上type = "source"

加上type参数,开始了

最后安装成功了,虽然中间那个报错不知道是啥,索性影响不大。

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